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Annonce des gagnants de la tâche 1, tâche 2 – Data Scientists – Nous avons besoin de vous!

Publié le 10 septembre 2020 par Tim Miller dans COVID-19

Nous avons vu la communauté scientifique se réunir à maintes reprises tout au long de la pandémie COVID-19, et nous sommes ravis d'avoir participé à un hackathon réunissant des scientifiques des données, des épidémiologistes et des organisations partenaires se concentrant sur l'analyse de l'hypothèse de savoir si la tuberculose ( TB) – BCG – pourrait réduire la mortalité par COVID-19.

Après le battage médiatique autour du COVID-19 et du BCG, Estafet et Elsevier se sont réunis pour voir s'ils pouvaient travailler avec des scientifiques des données et la communauté scientifique pour les aider à découvrir la véritable causalité – plutôt que la corrélation identifiée par les chercheurs. Le professeur Madhukar Pai (Département d'épidémiologie, de biostatistique et de santé au travail, Université McGill) a clairement mis en garde contre le risque d'attiser le battage médiatique et le danger de provoquer une course sur le vaccin BCG alors qu'il est encore très nécessaire. Lorsque Anita de Waard d’Elsevier (VP Research Collaborations) s’est entretenue avec le professeur Pai, il l’a mise en contact avec le Dr Alice Zwerling (Université d’Ottawa), qui est actuellement responsable de la maintenance du BCG World Atlas – un projet initié par le professeur Pai. Il est devenu clair que pour trouver de nouvelles informations pour les essais BCG-COVID 19, une meilleure utilisation de la puissance de la science des données serait d'augmenter les données du BCG World Atlas, de sorte que le hackathon a été divisé en deux.

Et les gagnants sont …

La tâche 1 – augmenter le BCG Atlas avec l'aide de la PNL (traitement du langage naturel) et de l'exploration de texte – s'est terminée ce mois-ci, aboutissant à la soumission de plus de 100 cahiers et à la génération d'une quantité substantielle de données à intégrer dans l'Atlas.

Le deuxième prix est allé à Marouane Benmeida. Marouane a généré 33 entités supplémentaires pour BCG Atlas et a reçu 2000 $.

Le premier prix est allé à Dimitrina Zlatkova. Dimitrina a généré 57 entités supplémentaires pour le BCG Atlas et a reçu 3000 $.

Ses
un résultat extraordinaire pour des temps extraordinaires, et nous aimerions beaucoup
merci non seulement Dimitrina et Marouane pour leurs excellentes contributions, mais tous
les bénévoles qui se sont réunis pour y parvenir! Les données créées par le
le hackathon aidera les corrélations actuelles avec COVID-19, mais est aussi en soi
d'une importance cruciale pour les chercheurs qui travaillent sur les vaccins contre la tuberculose.

Le hackathon continue

Et nous n’avons pas encore fini! Dans la tâche 2, les scientifiques des données utiliseront ces données augmentées pour trouver de nouvelles informations pour les essais cliniques BCG-COVID-19. Les participants chercheront à répondre à des questions telles que:

La vaccination par le BCG est-elle causalement liée à une réduction de la mortalité par COVID-19 ou d'autres facteurs tels que le verrouillage et l'âge moyen de la population sont responsables des différents taux de mortalité?

Si la vaccination BCG réduit le COVID-19
mortalité, quels sont les facteurs clés?
Par exemple:

  • Combien de temps l'immunité engendrée par le BCG dure-t-elle après la vaccination?
  • Quelle souche BCG a été utilisée?
  • Quel est le moment optimal pour vacciner?

Si vous avez été inspiré par ce résultat et que vous souhaitez participer à la deuxième tâche, nous serons heureux de recevoir toutes vos contributions. Pour des informations plus détaillées sur cette tâche et pour ceux qui souhaitent continuer à contribuer de nouvelles données au BCG Atlas, veuillez visiter le site du hackathon et impliquez-vous!

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